Podle ředitele muzea Iva Frolce naleznou pracovníci archeologického oddělení v přístavbě zázemí, laboratoře i depozitáře. Počítá se také s knihovnou zaměřenou na cyrilometodějskou tematiku a na období Velké Moravy. Záměr zahrnuje i přednáškové centrum a nové výstavní prostory pro krátkodobé výstavy a také pro stálou multimediální expozici Cyrila a Metoděje.
Obnova čeká archeologická naleziště na Výšině sv. Metoděje v Uherském Hradišti, ve Starém Městě – Špitálkách a v Modré u Velehradu. Podle Frolce zde bude instalován nový informační systém, lavičky i osvětlení. Opraveno bude zdivo a upraveny okolní plochy. Výšinu sv. Metoděje už upravuje uherskohradišťská radnice, zde budou změny nejmenší.
Památník Velké Moravy byl vybudován nad základy hřbitovního kostela z 9. století. Církevní stavbu obklopovalo ve velkomoravském období rozsáhlé pohřebiště. Pohřbeni zde byli jak příslušníci velkomoravské šlechty s bohatou výbavou se zbraněmi a šperky, tak i lidé chudí, zemědělci a řemeslníci. Památník je národní kulturní památkou. V roce 2010 byl rekonstruován, vznikla zde i nová multimediální expozice o životním příběhu jednoho Slovana.
