Luhačovická přehrada bývala ve Zlínském kraji z přírodních koupališť nejvíce problémová, zákaz koupání zde byl vydáván kvůli sinicím a velkému množství chlorofylu opakovaně. Naposledy zde před letošní sezonou platil v roce 2009. V letech 2010 až 2012 však bylo z přehrady odtěženo kolem 300 000 metrů krychlových bahna. Napuštěná přehrada je opět v provozu od léta 2013 a zdálo se, že investice za zhruba 150 milionů korun kvalitu vody v ní vylepšila. Aktuálně platný zákaz koupání je po odtěžení sedimentů vůbec první.
Oproti tomu na Pahrbku je v posledních letech vydáván opakovaně. Problémem této koupací oblasti je to, že voda je zde stojatá, neproudí a navíc jsou v ní nánosy usazenin. V ostatních přírodních koupalištích Zlínského kraje je voda zcela bez závad. Platí to pro přehrady Bystřička a Horní Bečva a štěrkoviště v Novém Hrozenkově na Vsetínsku, pro Štěrkáč v Otrokovicích a vodní nádrž Všemina na Zlínsku i pro přírodní koupaliště Albatros v Ostrožské Nové Vsi na Uherskohradišťsku.
Informace o kvalitě vody najdou návštěvníci na webu www.khszlin.cz a také ve vitrínách u jednotlivých přírodních koupališť. Poslední vzorky v letošní koupací sezoně hygienici odeberou na začátku září.